16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4159 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  611  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  31.82 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  27.69 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  30.82 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  27.46 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  32.41 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  21.74 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  25.75 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  24.81 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  24.55 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  21.88 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  22.27 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  24.24 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  24.34 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3240  hypothetical protein  38.57 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0144295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  30 
 
 		 428 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>