More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2730 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.54 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  47.02 
 
 
319 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  33.56 
 
 
345 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.1 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.58 
 
 
299 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  34.81 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  30.1 
 
 
309 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.64 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  32.98 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  33.68 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  32.41 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.1 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.97 
 
 
314 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 
314 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.83 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
291 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
314 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  32.65 
 
 
300 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
309 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  33.45 
 
 
293 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  32.4 
 
 
301 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  32.64 
 
 
310 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  32.64 
 
 
310 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
291 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.74 
 
 
329 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  31.71 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  33.45 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  32.29 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  31.56 
 
 
310 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  31.67 
 
 
341 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.77 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.42 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  32.62 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  31.14 
 
 
311 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  31.07 
 
 
299 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.78 
 
 
303 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.42 
 
 
303 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.72 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.42 
 
 
303 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.78 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.42 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.42 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.42 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  35 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  32.18 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  30.47 
 
 
294 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  30.95 
 
 
325 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  27.36 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  31.8 
 
 
299 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.61 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  30.58 
 
 
296 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  33.22 
 
 
309 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
301 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  33.45 
 
 
296 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
289 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
302 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  31.27 
 
 
300 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  29.21 
 
 
313 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 
305 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
314 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.07 
 
 
312 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  31.03 
 
 
322 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 
310 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  28.52 
 
 
302 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  34.8 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  33.68 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.02 
 
 
309 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.3 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.37 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.15 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  29.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  34.46 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.21 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  32.64 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.83 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.15 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.39 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  31.21 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  29.37 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.21 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  30.85 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  28.29 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>