17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0562 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  100 
 
 
491 aa  1019    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  89.21 
 
 
545 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  61.3 
 
 
532 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  36 
 
 
519 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  35.64 
 
 
549 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  34.65 
 
 
593 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
890 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  26.49 
 
 
330 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  39.62 
 
 
337 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  40.14 
 
 
337 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  27.81 
 
 
322 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  27.5 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  26.53 
 
 
350 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  25.54 
 
 
313 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  28.08 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  26.69 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  31.37 
 
 
343 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>