20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0034 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>