30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4257 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  51.3 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  47.74 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  47.74 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 816 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  33.23 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  27.99 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  27.8 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  27.61 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  27.61 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  27.61 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07622  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.09 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.79 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  25.71 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  25.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  29.36 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  29.55 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.63 
 
 		 375 aa  50.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.98 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  27.31 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.94 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  28.74 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  27.19 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  29.04 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  18.55 
 
 		 1067 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0672  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.26 
 
 		 1107 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.715776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.41 
 
 		 1120 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298922  normal  0.175677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  25.42 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.62 
 
 		 1077 aa  43.1  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>