More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4097 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4097  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 438 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.855735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2194  hypothetical protein  45.84 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0378977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0602  hypothetical protein  42.62 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  31.23 
 
 		 547 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.63 
 
 		 547 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.2 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.95 
 
 		 558 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.89 
 
 		 568 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.52 
 
 		 558 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.81 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.03 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.95 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.25 
 
 		 509 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.67 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.5 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.44 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  26.58 
 
 		 549 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.12 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31 
 
 		 561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.39 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.75 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.87 
 
 		 565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  28.8 
 
 		 549 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.13 
 
 		 559 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.59 
 
 		 558 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.39 
 
 		 533 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.91 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.65 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.11 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.97 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.39 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.47 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.16 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  25.53 
 
 		 549 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.64 
 
 		 517 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.95 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.22 
 
 		 553 aa  146  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.3 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.87 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.53 
 
 		 573 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.85 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.18 
 
 		 560 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.18 
 
 		 560 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  0.0000163657 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43325  predicted protein  27.1 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  25.26 
 
 		 549 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  28.69 
 
 		 525 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  28.23 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  25.57 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.32 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  30.88 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  27.84 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.24 
 
 		 546 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.02 
 
 		 546 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.97 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.28 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.74 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.74 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.73 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  32.6 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  28.09 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.8 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  28.46 
 
 		 557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.71 
 
 		 545 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.61 
 
 		 555 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.74 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.74 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.51 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.43 
 
 		 521 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  35.04 
 
 		 549 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.15 
 
 		 556 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30 
 
 		 537 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.97 
 
 		 557 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.92 
 
 		 559 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  25.86 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.92 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.43 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.19 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.91 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.91 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.57 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.5 
 
 		 523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.1 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  27.87 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.25 
 
 		 552 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.67 
 
 		 560 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.92 
 
 		 525 aa  137  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  29.36 
 
 		 606 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  26.26 
 
 		 558 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.2 
 
 		 561 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.14 
 
 		 560 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.83 
 
 		 552 aa  136  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.43 
 
 		 549 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  28.42 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  28.84 
 
 		 552 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.94 
 
 		 519 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.78 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  25.48 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>