43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3211 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  57.46 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  52.57 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  37.07 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  33.06 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  31.93 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  32.68 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  29.38 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  32.1 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  33.03 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  20.48 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  27.47 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  30.05 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  27.34 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  26.71 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  27.79 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  31.02 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  30.84 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  29.36 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  23.63 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  28.77 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  27.89 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  26.99 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  26.72 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  30.36 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  25.81 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  28.62 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  26.7 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  27.51 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  39.23 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  30.56 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  27.44 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  29.8 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  29.64 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  32.54 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  24.16 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  28.94 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  28.24 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  27.13 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  27.44 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  30.79 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  28.92 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  30.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>