14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2838 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1419 aa  785    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 946 aa  1931    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  64.35 
 
 		 1363 aa  1233    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.68 
 
 		 785 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  23.55 
 
 		 668 aa  99  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  30.26 
 
 		 1309 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  22.53 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  20.12 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  22.88 
 
 		 515 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08432  conserved hypothetical protein  20.35 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  19.96 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  33.09 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  30.59 
 
 		 516 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  29.77 
 
 		 772 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>