222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1985 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1985  Clp domain protein  100 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6756  ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit-like protein  52.23 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  36.14 
 
 		 851 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  38.46 
 
 		 861 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  36.97 
 
 		 837 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  39.44 
 
 		 850 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  39.16 
 
 		 842 aa  89  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 836 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.16 
 
 		 858 aa  88.6  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  38.46 
 
 		 830 aa  88.6  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  38.46 
 
 		 839 aa  88.6  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 841 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 854 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  37.75 
 
 		 855 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 830 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  38.46 
 
 		 830 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  34.38 
 
 		 852 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  38.46 
 
 		 844 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  38.41 
 
 		 840 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  38.46 
 
 		 836 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  38.46 
 
 		 844 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 851 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  38.46 
 
 		 834 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  37.76 
 
 		 835 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 858 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 866 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 834 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  38.46 
 
 		 834 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 848 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  40.56 
 
 		 829 aa  86.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  38.73 
 
 		 852 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  38.46 
 
 		 846 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  41.53 
 
 		 810 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.57 
 
 		 851 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  37.76 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  37.76 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  37.76 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  37.76 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  41.13 
 
 		 868 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  37.76 
 
 		 847 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  37.76 
 
 		 847 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  37.76 
 
 		 848 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  36.81 
 
 		 812 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  30.73 
 
 		 814 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  38.69 
 
 		 825 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  36.18 
 
 		 879 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  41.73 
 
 		 812 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  37.23 
 
 		 824 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  39.66 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  37.5 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  37.96 
 
 		 823 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  38.3 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  37.86 
 
 		 852 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  35.46 
 
 		 869 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  35.77 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  33.33 
 
 		 842 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 824 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  35.51 
 
 		 822 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  35.51 
 
 		 822 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3476  Clp domain protein  34.17 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.689298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  39.13 
 
 		 859 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  40 
 
 		 843 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  39.13 
 
 		 855 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 855 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  35.83 
 
 		 820 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  39.13 
 
 		 843 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  39.13 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  39.13 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  39.13 
 
 		 841 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  31.61 
 
 		 944 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  33.74 
 
 		 812 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 842 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.04 
 
 		 862 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  37.59 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  33.12 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6891  ATPase  31.61 
 
 		 944 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  31.82 
 
 		 814 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  30.89 
 
 		 811 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  30.89 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  31.89 
 
 		 811 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  36.11 
 
 		 860 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  29.84 
 
 		 811 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  31.35 
 
 		 811 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  35.65 
 
 		 815 aa  65.1  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  30.41 
 
 		 811 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 1711 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  33.96 
 
 		 814 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  33.33 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  31.09 
 
 		 942 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  33.93 
 
 		 840 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  33.91 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  36.57 
 
 		 854 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  36.62 
 
 		 816 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>