142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1322 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1322  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
854 aa  1708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4731  serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 
839 aa  618  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6433  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.09 
 
 
878 aa  619  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642211  normal  0.0697587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4239  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
870 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4848  serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
880 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0532  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.332532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3610  serine/threonine protein kinase  42.89 
 
 
866 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.76 
 
 
873 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1744  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
860 aa  348  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00380667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
861 aa  301  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0246  serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
896 aa  241  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4758  serine/threonine protein kinase, putative  29.83 
 
 
838 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000666058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
894 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
865 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2549  Serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
614 aa  119  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
880 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
864 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1920  hypothetical protein  24.57 
 
 
719 aa  90.1  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0417  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 
412 aa  67  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
505 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  30.91 
 
 
502 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 
486 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  26.53 
 
 
641 aa  61.6  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  31.75 
 
 
571 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
571 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  27.57 
 
 
579 aa  58.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25 
 
 
614 aa  57.8  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 
651 aa  57.8  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.23 
 
 
623 aa  56.6  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  27.36 
 
 
569 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
700 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  27 
 
 
634 aa  55.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
623 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3647  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
480 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  25.81 
 
 
623 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  25.81 
 
 
621 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
585 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
483 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
574 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
900 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  28.19 
 
 
585 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  24.26 
 
 
625 aa  52.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  28.64 
 
 
626 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
871 aa  52.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.47 
 
 
1016 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  28.26 
 
 
488 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.17 
 
 
1110 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37967  predicted protein  44.3 
 
 
296 aa  51.2  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222165  normal  0.400383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 
652 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.43 
 
 
1044 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 
1327 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
586 aa  51.2  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  27.19 
 
 
476 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
537 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
507 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 
548 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
430 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
430 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  28.57 
 
 
574 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
431 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 
416 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.9 
 
 
696 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
729 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5979  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 
1214 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
450 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
715 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
671 aa  49.3  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
574 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  26.96 
 
 
475 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  25.41 
 
 
461 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
1818 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  26.44 
 
 
427 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4665  protein kinase  33.59 
 
 
307 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  26.96 
 
 
565 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.08 
 
 
521 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.85 
 
 
556 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  24.12 
 
 
500 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
444 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 
576 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
625 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
266 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3498  protein kinase  31.48 
 
 
459 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.744246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.03 
 
 
1036 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 
718 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
556 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
898 aa  47.8  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
707 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 
376 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
569 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  25.76 
 
 
485 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  28.74 
 
 
589 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  27.97 
 
 
1108 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
572 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  28.11 
 
 
451 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  25.45 
 
 
762 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.49 
 
 
717 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.1 
 
 
1832 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>