21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1283 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1283  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1989  hypothetical protein  46.08 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.123157 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  27.88 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.6 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0099  hypothetical protein  26.43 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1521  taurine catabolism dioxygenase TauD  26.43 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1604  taurine catabolism dioxygenase TauD  26.43 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2242  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.89 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.85 
 
 		 407 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3719  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.97 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0650  hypothetical protein  24.52 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1652  putative taurine catabolism dioxygenase  29.78 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  25.97 
 
 		 549 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  25.44 
 
 		 519 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1058  hypothetical protein  28.93 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  24.03 
 
 		 447 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2184  taurine catabolism dioxygenase  28.25 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.415613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.33 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  28.12 
 
 		 387 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.88 
 
 		 382 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>