17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0796 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0796  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06440  hypothetical protein  54.49 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  51.95 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  51.95 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  48.65 
 
 		 129 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  35.2 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  42.11 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  49.3 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  46.38 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  34.02 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  44.93 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  44.62 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  30.23 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1858  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  34.25 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  34.18 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  37.31 
 
 		 334 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>