40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1597 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  72.49 
 
 		 271 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.26 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.13 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  43.97 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.6 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.38 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.13 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.38 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.55 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.56 
 
 		 275 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.7 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.08 
 
 		 268 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.08 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.47 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.39 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.6 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  24.46 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  24.46 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  24.46 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  24.73 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.2 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  22.05 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.33 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.1 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  31.36 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.56 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  32.5 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  27.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  26.13 
 
 		 428 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.1 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.21 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  29.01 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.48 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.16 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1772  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.01 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.71 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>