269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0217 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  62.75 
 
 
112 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  52.88 
 
 
118 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  50.91 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  63.73 
 
 
119 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  52.88 
 
 
121 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  52.88 
 
 
121 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  50.46 
 
 
130 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  47.27 
 
 
123 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  50.49 
 
 
120 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  54.26 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  58.65 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  56.25 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  51.82 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  43.3 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34 
 
 
345 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.09 
 
 
348 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1181  ferredoxin  43.48 
 
 
219 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897222  normal  0.136525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.33 
 
 
407 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.41 
 
 
360 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.09 
 
 
341 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.9 
 
 
348 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.74 
 
 
338 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.78 
 
 
403 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  34.74 
 
 
338 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.28 
 
 
350 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.48 
 
 
350 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.48 
 
 
350 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  41.67 
 
 
605 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.71 
 
 
388 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  36.36 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
354 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.81 
 
 
341 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  41.82 
 
 
366 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.85 
 
 
367 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.25 
 
 
350 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.47 
 
 
387 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  36.67 
 
 
356 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.71 
 
 
344 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  34.48 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  38.16 
 
 
319 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  34.48 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  30.39 
 
 
342 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.43 
 
 
354 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.67 
 
 
376 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.56 
 
 
380 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.63 
 
 
406 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.47 
 
 
349 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.78 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  32.99 
 
 
486 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.41 
 
 
343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  34.07 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  33.33 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.88 
 
 
358 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.86 
 
 
349 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.71 
 
 
881 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.36 
 
 
339 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  31.03 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.43 
 
 
351 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.88 
 
 
358 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.88 
 
 
358 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  38.71 
 
 
881 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.71 
 
 
881 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.93 
 
 
349 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.27 
 
 
343 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.76 
 
 
382 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  29.76 
 
 
341 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.88 
 
 
358 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30 
 
 
336 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.48 
 
 
346 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.45 
 
 
340 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  37.31 
 
 
356 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.27 
 
 
343 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.93 
 
 
349 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  32.97 
 
 
325 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08710  ferredoxin, XylT  45.83 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.16 
 
 
338 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
625 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.48 
 
 
380 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0711  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.61 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.35 
 
 
848 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  35.56 
 
 
365 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  32.58 
 
 
353 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  30.43 
 
 
588 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.67 
 
 
702 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.52 
 
 
562 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.41 
 
 
350 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  31.46 
 
 
369 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  35.29 
 
 
361 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.59 
 
 
357 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  31.46 
 
 
369 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>