51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1181 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1181  ferredoxin  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897222  normal  0.136525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  43.48 
 
 
111 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  42.22 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  41.11 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  39.56 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  43.33 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  43.33 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  40.4 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  38.71 
 
 
118 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  38.89 
 
 
121 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  57.41 
 
 
117 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  44.09 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
349 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
348 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  32.58 
 
 
341 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.63 
 
 
345 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.26 
 
 
357 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  41.11 
 
 
112 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.77 
 
 
350 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.63 
 
 
332 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  40.86 
 
 
124 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3849  ferredoxin  46.15 
 
 
93 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.05965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.14 
 
 
330 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  35.14 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  38.24 
 
 
120 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.07 
 
 
348 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.4 
 
 
350 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.4 
 
 
350 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.76 
 
 
331 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  28.26 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.26 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0140  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  39.51 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.46 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.21 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1650  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.52 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  34.21 
 
 
342 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  40 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  34.88 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  43.96 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  33.78 
 
 
83 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  29.41 
 
 
327 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
341 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.38 
 
 
929 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  28.72 
 
 
342 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  33.33 
 
 
334 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 
353 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.4 
 
 
333 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.95 
 
 
350 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.91 
 
 
407 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  34.62 
 
 
348 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>