More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1994 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1994  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1996  Rhodanese domain protein  91.38 
 
 
240 aa  208  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  44.36 
 
 
335 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  45 
 
 
310 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.44 
 
 
285 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  42.51 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.89 
 
 
285 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  45.61 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
284 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
275 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.49 
 
 
284 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.99 
 
 
284 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  42.66 
 
 
284 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  38.43 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  38.43 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 
276 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  41.61 
 
 
297 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  40.46 
 
 
288 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.33 
 
 
276 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.17 
 
 
627 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
283 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  42.32 
 
 
282 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.58 
 
 
284 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  32.3 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.19 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  42.75 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
278 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  36.3 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  40.77 
 
 
283 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
291 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 
291 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 
282 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.48 
 
 
281 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.86 
 
 
276 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
284 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  41.91 
 
 
270 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  32.06 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  40.67 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  35.86 
 
 
272 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  40.97 
 
 
276 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
287 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  32.06 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  38.81 
 
 
312 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
301 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  41.99 
 
 
277 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 
288 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  40.35 
 
 
288 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  42.32 
 
 
282 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
281 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  41.79 
 
 
375 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.28 
 
 
282 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  32.08 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.97 
 
 
277 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.55 
 
 
287 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  30.97 
 
 
277 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  30.97 
 
 
277 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  30.97 
 
 
277 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  38.15 
 
 
289 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  38.33 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.18 
 
 
284 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  39.25 
 
 
270 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  35.76 
 
 
284 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  41.15 
 
 
299 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  36.29 
 
 
278 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.64 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.78 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.45 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  38.46 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  36.64 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
284 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  37.45 
 
 
285 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
290 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.94 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  34.14 
 
 
285 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 
277 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  41.54 
 
 
301 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  37.79 
 
 
289 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  30.19 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.16 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  36.33 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  40.6 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1199  Rhodanese domain protein  40.16 
 
 
279 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000276254  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  40.44 
 
 
687 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
276 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>