248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1559 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
443 aa  877    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
443 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.09 
 
 
424 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
437 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 
433 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.52 
 
 
439 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
432 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
465 aa  342  7e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.75 
 
 
433 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
448 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 
465 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
450 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
442 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 
428 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.71 
 
 
433 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  47.82 
 
 
442 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
438 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.47 
 
 
438 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
443 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 
427 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
454 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51 
 
 
450 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 
440 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.57 
 
 
473 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
442 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
454 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  49 
 
 
440 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.95 
 
 
487 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
487 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
488 aa  229  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
462 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 
487 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 
487 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
491 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 
441 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 
487 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
453 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
453 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
451 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 
489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
489 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 
501 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
489 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 
479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 
453 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
446 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
453 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  34.4 
 
 
458 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.48 
 
 
452 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.34 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
458 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
485 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.34 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
460 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 
451 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
461 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
490 aa  209  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 
478 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
486 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
451 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
458 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
467 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
480 aa  206  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
476 aa  206  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
467 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
475 aa  205  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 
457 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
480 aa  202  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
498 aa  201  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 
505 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
468 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
490 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>