299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1004 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1004  Polyphosphate kinase  100 
 
 		 689 aa  1367    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.695447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  51.41 
 
 		 769 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  51.41 
 
 		 760 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  52.02 
 
 		 691 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  51.43 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  50.73 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  51.52 
 
 		 750 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  50.99 
 
 		 728 aa  628  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  50.98 
 
 		 687 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  50.07 
 
 		 721 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  50.98 
 
 		 729 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  49.93 
 
 		 737 aa  618  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  49.49 
 
 		 763 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  50.15 
 
 		 741 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  49.93 
 
 		 731 aa  611  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  50.23 
 
 		 696 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  51.3 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  51.13 
 
 		 730 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  50.67 
 
 		 743 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  51.42 
 
 		 703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  50.82 
 
 		 742 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  50.82 
 
 		 742 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  50.82 
 
 		 742 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  49.47 
 
 		 712 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  47.5 
 
 		 745 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  49.13 
 
 		 744 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  46.13 
 
 		 722 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  47.12 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  46.13 
 
 		 722 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  46.5 
 
 		 749 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  46.87 
 
 		 745 aa  589  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  47.19 
 
 		 766 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  48.97 
 
 		 705 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  46.72 
 
 		 721 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  46.43 
 
 		 736 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  47.15 
 
 		 765 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  47.61 
 
 		 762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  44.97 
 
 		 712 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  46.98 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  46.3 
 
 		 731 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  50.08 
 
 		 882 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  45.39 
 
 		 721 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  47.22 
 
 		 770 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  48.36 
 
 		 693 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  47.06 
 
 		 708 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  46.88 
 
 		 749 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  44.74 
 
 		 713 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  46.28 
 
 		 714 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  42.94 
 
 		 720 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  46.77 
 
 		 695 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  47.56 
 
 		 702 aa  554  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  43.57 
 
 		 712 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  46.73 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  41.22 
 
 		 709 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  41.22 
 
 		 709 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  45.68 
 
 		 710 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  41.37 
 
 		 705 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  45.16 
 
 		 726 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.22 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  46.56 
 
 		 729 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  45.47 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  44.62 
 
 		 743 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  44.59 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  41.74 
 
 		 709 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  43.94 
 
 		 764 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  42.16 
 
 		 713 aa  525  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  45.36 
 
 		 788 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  45.6 
 
 		 759 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  45.36 
 
 		 788 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  45.66 
 
 		 788 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  45.66 
 
 		 749 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  43.89 
 
 		 741 aa  525  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  47.1 
 
 		 726 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  45.51 
 
 		 790 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  42.02 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  43.14 
 
 		 746 aa  522  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  43.47 
 
 		 733 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  45.43 
 
 		 750 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  39.91 
 
 		 681 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  44.53 
 
 		 736 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  43.28 
 
 		 823 aa  519  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  43.14 
 
 		 746 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  43.43 
 
 		 801 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  44.28 
 
 		 743 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  42.11 
 
 		 707 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  39.26 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  44.73 
 
 		 733 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  39.11 
 
 		 692 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  40.21 
 
 		 692 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  43.98 
 
 		 736 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  43.47 
 
 		 742 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  44.57 
 
 		 736 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  42.08 
 
 		 713 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  39.56 
 
 		 694 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  41.47 
 
 		 708 aa  511  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  44.33 
 
 		 736 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  43.51 
 
 		 734 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  40.5 
 
 		 707 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  43.37 
 
 		 734 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  43.96 
 
 		 753 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>