274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0004 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0003  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0004  tRNA-Asp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0004  tRNA-Asp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0041  tRNA-Asp  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00163216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0036  tRNA-Asp  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0037  tRNA-Asp  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.060369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0045  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0002  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0046  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0072  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217203  normal  0.378802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0071  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.146607  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0029  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000411278  normal  0.024303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0031  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000438014  normal  0.0251271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0023  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000368912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0041  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000931671  normal  0.0847681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0021  tRNA-Asp  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0003  tRNA-Asp  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000762026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  84.42 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0048  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000611669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04530  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000141295  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04532  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000147754  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0038  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0017  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0025  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000547625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0028  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000186167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0023  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.700575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0049  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.529463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0042  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0046  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0020  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0040  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291088  normal  0.300021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0043  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193978  normal  0.0518399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0020  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.015357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0043  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.555822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0039  tRNA-Asp  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t27  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t44  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t45  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t46  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00513183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1372  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0247  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2538  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00838842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000082024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA30  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000254834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0060  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2536  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0232654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0059  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0311409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0057  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0060  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000184808  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2324  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0066  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0021  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2351  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0030  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000948494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0031  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000010181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0068  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2484  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000127815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3214  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106519  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21810  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000145079  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24120  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000157836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24130  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000273209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41200  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259841  normal  0.399457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0054  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000254404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0083  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>