28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4265 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  100 
 
 
717 aa  1371    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  76.39 
 
 
720 aa  921    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  96.93 
 
 
717 aa  1269    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  97.49 
 
 
717 aa  1254    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  33.14 
 
 
703 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  30.1 
 
 
710 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  25.28 
 
 
825 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  26.2 
 
 
773 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  21.63 
 
 
682 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  30.32 
 
 
660 aa  78.2  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  31.76 
 
 
684 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  38.16 
 
 
872 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  28.02 
 
 
641 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  20.83 
 
 
677 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  30.51 
 
 
700 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  26.44 
 
 
933 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  23.5 
 
 
627 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  25.5 
 
 
640 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  28.38 
 
 
939 aa  53.9  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  30.5 
 
 
937 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  26.83 
 
 
957 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  38.81 
 
 
939 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1322  hypothetical protein  32.14 
 
 
397 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.143709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  35.9 
 
 
938 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  36.36 
 
 
937 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  38.03 
 
 
914 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  31.73 
 
 
939 aa  44.3  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  33.01 
 
 
945 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>