20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0768 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  53.57 
 
 		 57 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  60.47 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  44.64 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 61 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  36.51 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  38 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2707  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.18 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  38.18 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>