More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2751 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  53.26 
 
 
660 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  100 
 
 
661 aa  1291    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  57.14 
 
 
642 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  47.42 
 
 
670 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  46.44 
 
 
669 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  46.14 
 
 
667 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  44.34 
 
 
671 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  42.81 
 
 
681 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  43.33 
 
 
675 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  43.82 
 
 
683 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  46.85 
 
 
678 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  46.85 
 
 
678 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  44.61 
 
 
688 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  41.74 
 
 
688 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  43.96 
 
 
683 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  43.62 
 
 
699 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  43.01 
 
 
696 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  44.79 
 
 
682 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  41.14 
 
 
678 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  43.27 
 
 
680 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  41.14 
 
 
678 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  44.07 
 
 
655 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  43.52 
 
 
686 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  41.36 
 
 
676 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  42.86 
 
 
671 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  41 
 
 
662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  35.33 
 
 
653 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  35.73 
 
 
653 aa  362  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  31.79 
 
 
694 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  32.11 
 
 
695 aa  343  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.34 
 
 
682 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  32.75 
 
 
692 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  33.63 
 
 
692 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  34.25 
 
 
688 aa  340  4e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  34.7 
 
 
686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.14 
 
 
691 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.62 
 
 
691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  32.6 
 
 
691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  31.18 
 
 
696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  34.42 
 
 
697 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  35.6 
 
 
697 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  31.48 
 
 
695 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.74 
 
 
692 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  33.01 
 
 
693 aa  324  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  33.43 
 
 
688 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.17 
 
 
689 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  30.44 
 
 
697 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  34.31 
 
 
695 aa  320  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  31.37 
 
 
691 aa  320  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  32.63 
 
 
695 aa  317  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  32.15 
 
 
687 aa  316  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  32.9 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.9 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  32.9 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  32.9 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.9 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.74 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  32.58 
 
 
692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.69 
 
 
692 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  32.68 
 
 
696 aa  314  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  32.52 
 
 
692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.11 
 
 
696 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.83 
 
 
680 aa  313  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  30.75 
 
 
679 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.64 
 
 
692 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  32.52 
 
 
692 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  32.17 
 
 
692 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  31.8 
 
 
670 aa  313  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.02 
 
 
692 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.49 
 
 
692 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  32.36 
 
 
692 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  31.82 
 
 
689 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  32.2 
 
 
692 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  32.69 
 
 
704 aa  310  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  32.07 
 
 
701 aa  310  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  33.17 
 
 
697 aa  309  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  31.83 
 
 
697 aa  309  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  32.49 
 
 
682 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  32.2 
 
 
686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0755  elongation factor G  33.28 
 
 
707 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  28.7 
 
 
696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  28.7 
 
 
696 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  30.51 
 
 
683 aa  308  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  31.32 
 
 
689 aa  308  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.52 
 
 
692 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0273  elongation factor G  32.32 
 
 
705 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.67 
 
 
691 aa  307  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  30.49 
 
 
690 aa  307  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  33.77 
 
 
691 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  31.69 
 
 
694 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  31.28 
 
 
704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  30.51 
 
 
701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  32.85 
 
 
701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  30.39 
 
 
685 aa  306  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.6 
 
 
697 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  32.53 
 
 
692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  31.49 
 
 
692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  32.74 
 
 
704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  30.88 
 
 
691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  30.68 
 
 
685 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>