More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0787 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  96.36 
 
 
274 aa  324  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  69.81 
 
 
312 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  70.19 
 
 
284 aa  228  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  68.1 
 
 
372 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  67.92 
 
 
307 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  68.35 
 
 
309 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  75 
 
 
260 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  63.52 
 
 
309 aa  207  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  63.52 
 
 
309 aa  207  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  63.52 
 
 
309 aa  207  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  71.14 
 
 
269 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  70.47 
 
 
269 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  69.8 
 
 
269 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  69.8 
 
 
269 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  69.8 
 
 
231 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  66.43 
 
 
290 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  66.43 
 
 
290 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  66.43 
 
 
290 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  66.43 
 
 
290 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  68.57 
 
 
290 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  65.47 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  65.47 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  65.47 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  65.47 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  65.47 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  64.03 
 
 
237 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  64.03 
 
 
237 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  64.03 
 
 
237 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  64.03 
 
 
237 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  57.49 
 
 
393 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  61.15 
 
 
264 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  56.6 
 
 
306 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5483  putative integrase  65.47 
 
 
155 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.704423 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  55.97 
 
 
309 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  55.97 
 
 
309 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  55.97 
 
 
309 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  55.97 
 
 
375 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  52.83 
 
 
309 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  52.83 
 
 
309 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  52.83 
 
 
309 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  53.46 
 
 
309 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  52.83 
 
 
309 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  55.09 
 
 
298 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  48.57 
 
 
274 aa  141  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  67 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
282 aa  137  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
282 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  46.1 
 
 
276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  47.14 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  48.23 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  46.81 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1523  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1542  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1837  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00170274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1940  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2101  IS407A, transposase OrfB  46.81 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>