38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0699 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0699  RecB family-like nuclease  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3973  hypothetical protein  38.68 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1075  protein of unknown function DUF91  28.37 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.756006  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0058  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000572818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1275  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.319889  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0508  hypothetical protein  46.27 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2401  hypothetical protein  27.92 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0757  hypothetical protein  40.45 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3761  hypothetical protein  36 
 
 
556 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1741  hypothetical protein  40.45 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2601  protein of unknown function DUF91  37.31 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0240  hypothetical protein  36.36 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.691595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10060  predicted nuclease of the RecB family  27.92 
 
 
231 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1310  hypothetical protein  29.41 
 
 
231 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0027  protein of unknown function DUF91  36.07 
 
 
236 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1036  hypothetical protein  32.93 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0664  hypothetical protein  27.81 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0762495  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2599  hypothetical protein  29.37 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1121  hypothetical protein  26.76 
 
 
256 aa  45.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1011  protein of unknown function DUF91  35.62 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0135  hypothetical protein  28.69 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.823284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1229  hypothetical protein  36.84 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29400  hypothetical protein  29.32 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0328  protein of unknown function DUF91  33.33 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1688  nuclease of the RecB family-like protein  28.39 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0350  protein of unknown function DUF91  27.45 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1771  hypothetical protein  38.96 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19090  hypothetical protein  38.16 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0168  hypothetical protein  34.33 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.916253  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0174  hypothetical protein  40.3 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.263506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3695  hypothetical protein  32.88 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.547538  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2332  hypothetical protein  31.67 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000909296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3903  protein of unknown function DUF91  25.97 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.454953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08210  hypothetical protein  28.21 
 
 
231 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0876113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4120  protein of unknown function DUF91  36 
 
 
223 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11352  hypothetical protein  35.53 
 
 
226 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>