More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3874 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3874  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.78 
 
 
300 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.78 
 
 
300 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.73 
 
 
300 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
300 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.68 
 
 
300 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.88 
 
 
299 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.85 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.85 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.16 
 
 
302 aa  401  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.13 
 
 
308 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.09 
 
 
292 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.1 
 
 
315 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.13 
 
 
308 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.88 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.35 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.29 
 
 
293 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.43 
 
 
291 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.65 
 
 
294 aa  394  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.59 
 
 
294 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.65 
 
 
294 aa  394  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  64.14 
 
 
294 aa  391  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.38 
 
 
290 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.38 
 
 
290 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0539  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
294 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.38 
 
 
290 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1927  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.86 
 
 
295 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0416872  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1645  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.86 
 
 
295 aa  390  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  0.44525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.38 
 
 
290 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  63.79 
 
 
294 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.17 
 
 
291 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.17 
 
 
291 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1125  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.86 
 
 
294 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0337157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.08 
 
 
296 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.08 
 
 
291 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.29 
 
 
294 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0279  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.9 
 
 
294 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0600383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.21 
 
 
296 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.21 
 
 
294 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0543  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.86 
 
 
294 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.86 
 
 
296 aa  387  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.4 
 
 
290 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0185  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
294 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1585  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.29 
 
 
294 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.71 
 
 
290 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2163  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.29 
 
 
294 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  62.89 
 
 
291 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.16 
 
 
294 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0466  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  67.11 
 
 
299 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.2 
 
 
291 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.25 
 
 
278 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.51 
 
 
294 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  65.49 
 
 
290 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0921  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.61 
 
 
294 aa  384  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.16 
 
 
294 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0230  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.61 
 
 
294 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0421  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  65.52 
 
 
294 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0403  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.11 
 
 
300 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0844836  hitchhiker  0.0012368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.08 
 
 
288 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.58 
 
 
291 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.05 
 
 
290 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
290 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1748  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  66.78 
 
 
299 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  63.38 
 
 
292 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.01 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
290 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.01 
 
 
290 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.01 
 
 
290 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.01 
 
 
290 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  64.01 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.01 
 
 
290 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1209  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.37 
 
 
291 aa  374  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  64.36 
 
 
290 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.32 
 
 
290 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.67 
 
 
290 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.86 
 
 
290 aa  374  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
295 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
295 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
295 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
289 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>