26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3052 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3052  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
359 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1692  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1882  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442925  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1680  hypothetical protein  30.88 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27 
 
 
810 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
878 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05590  hypothetical protein  24.53 
 
 
319 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.901081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.96 
 
 
832 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
729 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
3172 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 
632 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  18.75 
 
 
1486 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 
878 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
1737 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
808 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.14 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.23 
 
 
3145 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  22.36 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  21.33 
 
 
795 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  29.3 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.09 
 
 
733 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.21 
 
 
887 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
274 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>