18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2079 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  100 
 
 
709 aa  1420    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  50.17 
 
 
1189 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  48.94 
 
 
673 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  48.91 
 
 
974 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  38.61 
 
 
1117 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  51.09 
 
 
1083 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  44.74 
 
 
1126 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  49.65 
 
 
1182 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  45.17 
 
 
924 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  44.95 
 
 
968 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  42.24 
 
 
847 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  45.3 
 
 
833 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  46.67 
 
 
164 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2045  hypothetical protein  25.73 
 
 
280 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  38.46 
 
 
638 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4441  hypothetical protein  25.17 
 
 
314 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0365  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  40.74 
 
 
1630 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>