44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1523 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1523  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 73 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  41.67 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  43.48 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  36.11 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  38.89 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  42.25 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  37.68 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  35.21 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  35.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  35.21 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  33.8 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0043  protein of unknown function UPF0044  35.21 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  35.21 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  38.03 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  33.8 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  40.98 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1077  hypothetical protein  37.68 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  29.58 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  31.51 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  34.25 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  32.39 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  32.43 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0230  RNA-binding protein  36.21 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  32.39 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  31.88 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  32.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  32.81 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1043  protein of unknown function UPF0044  43.06 
 
 		 82 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  31.08 
 
 		 139 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>