More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0008 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 
1477 bp  2914    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1478 bp  2930    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1479 bp  1546    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 
1465 bp  1445    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 
1479 bp  1816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 
1474 bp  1836    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 
1479 bp  1816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  91.03 
 
 
1479 bp  1824    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  90.96 
 
 
1479 bp  1816    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 
1474 bp  1836    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 
1394 bp  1283    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1488 bp  2413    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1490 bp  2413    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1488 bp  2413    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  95.81 
 
 
1490 bp  2413    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 
1479 bp  1433    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  87.54 
 
 
1458 bp  1394    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 
1440 bp  1382    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 
1440 bp  1382    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 
1477 bp  2914    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  87.57 
 
 
1498 bp  1423    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  87.46 
 
 
1465 bp  1398    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  88.66 
 
 
1490 bp  1558    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  88.66 
 
 
1490 bp  1558    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  88.39 
 
 
1479 bp  1538    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1479 bp  1546    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 
1477 bp  2914    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 
1482 bp  1739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 
1482 bp  1739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  87.39 
 
 
1465 bp  1390    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 
1465 bp  1382    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  87.32 
 
 
1465 bp  1382    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  87.29 
 
 
1401 bp  1320    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  87.29 
 
 
1401 bp  1320    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 
1540 bp  551  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 
1540 bp  551  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 
1540 bp  551  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 
1540 bp  551  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  541  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  541  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  541  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  533  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1523 bp  517  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1523 bp  517  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1523 bp  517  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  80.28 
 
 
1523 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  80.28 
 
 
1523 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  80.28 
 
 
1523 bp  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  80.23 
 
 
1524 bp  502  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  80.23 
 
 
1524 bp  502  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1639 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 
1641 bp  480  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 
1587 bp  472  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 
1587 bp  472  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  80.9 
 
 
1535 bp  470  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  82.85 
 
 
1641 bp  472  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  80.9 
 
 
1535 bp  470  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  85.81 
 
 
1502 bp  466  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1587 bp  464  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 
1530 bp  460  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 
1689 bp  460  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1587 bp  456  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1587 bp  456  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 
1538 bp  430  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 
1543 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 
1537 bp  430  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 
1543 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 
1543 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  82.32 
 
 
1543 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 
1556 bp  424  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1538 bp  422  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1538 bp  422  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 
1548 bp  418  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  81.45 
 
 
1548 bp  410  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  81.45 
 
 
1548 bp  410  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 
1555 bp  410  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 
1548 bp  398  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0001  16S ribosomal RNA  88.19 
 
 
1465 bp  398  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000564687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 
1548 bp  398  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 
1548 bp  398  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0020  16S ribosomal RNA  88.19 
 
 
1464 bp  398  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000408702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 
1548 bp  398  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0007  16S ribosomal RNA  88.19 
 
 
1561 bp  398  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0014  16S ribosomal RNA  88.19 
 
 
1465 bp  398  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000553365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0056  16S ribosomal RNA  88.19 
 
 
1465 bp  398  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000698586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  82.24 
 
 
1525 bp  394  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  80.61 
 
 
1563 bp  394  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  80.61 
 
 
1563 bp  394  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  82.24 
 
 
1525 bp  394  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_893  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 
1490 bp  391  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.11071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>