42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4257 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
634 aa  1263    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  31.26 
 
 
907 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  30.19 
 
 
664 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.06 
 
 
1056 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  28.65 
 
 
671 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  30.34 
 
 
663 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  27.1 
 
 
462 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  30.78 
 
 
716 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  30.95 
 
 
953 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  28.76 
 
 
867 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  28.96 
 
 
1233 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
1121 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.9 
 
 
746 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  28.68 
 
 
938 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
818 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.89 
 
 
891 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.61 
 
 
1283 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 
396 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
1215 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  41.67 
 
 
606 aa  48.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.59 
 
 
1035 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.83 
 
 
524 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 
500 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.95 
 
 
444 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  38.75 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.85 
 
 
883 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 
710 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  29.76 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 
557 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 
703 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.79 
 
 
635 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0883  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 
1146 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581781 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
392 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  35.62 
 
 
1028 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.19 
 
 
453 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  28.75 
 
 
562 aa  44.3  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 
966 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.46 
 
 
635 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.35 
 
 
690 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  32.93 
 
 
576 aa  44.3  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.84 
 
 
501 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.61 
 
 
682 aa  43.9  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>