15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0525 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1147    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  38.91 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  36.03 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  28.39 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  25.1 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  33.77 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  32.08 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  31.76 
 
 		 549 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  31.29 
 
 		 775 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  29.95 
 
 		 316 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  30.46 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  30.64 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4263  hypothetical protein  22.57 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  28.57 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.46 
 
 		 859 aa  43.9  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>