58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1686 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  100 
 
 		 88 aa  173  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  100 
 
 		 88 aa  173  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  76.25 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  69.62 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  62.35 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  67.53 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  63.75 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  56.63 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  54.22 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  51.22 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  53.01 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  50.62 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  50.62 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  51.81 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  50 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  50 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  50 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  54.22 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  51.81 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  51.76 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  53.57 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  53.57 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  50.59 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  50.59 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  50 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  53.09 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  53.09 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  53.75 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  54.43 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  51.85 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  55.29 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  51.76 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  48.1 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  48.1 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  49.4 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  48.19 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45.68 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  48.15 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  52.94 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  45.68 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.65 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  36.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  36.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  36.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1048  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 82 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1172  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.82 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.96 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>