More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3036 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  99.65 
 
 
286 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  97.2 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  83.92 
 
 
282 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.49 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.53 
 
 
266 aa  252  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.35 
 
 
265 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  42.58 
 
 
271 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  38.4 
 
 
282 aa  214  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.27 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.12 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  45.74 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  45.74 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  45.39 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.51 
 
 
379 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.49 
 
 
398 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.24 
 
 
359 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  42.91 
 
 
377 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  46.18 
 
 
372 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.8 
 
 
373 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.7 
 
 
358 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.25 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.83 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.35 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  42.19 
 
 
379 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.58 
 
 
372 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.15 
 
 
369 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  40.94 
 
 
380 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.35 
 
 
376 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.82 
 
 
369 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 
368 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.57 
 
 
367 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  41.54 
 
 
378 aa  192  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  41.73 
 
 
372 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.73 
 
 
372 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  38.82 
 
 
389 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.09 
 
 
375 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  40.16 
 
 
368 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.11 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  40.64 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  40.64 
 
 
377 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.28 
 
 
396 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  41.37 
 
 
376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.61 
 
 
360 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  39.37 
 
 
367 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  41.46 
 
 
377 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  40.65 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  39.46 
 
 
367 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.84 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  41.77 
 
 
344 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.91 
 
 
360 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.92 
 
 
395 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.17 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.62 
 
 
370 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.75 
 
 
370 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.35 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.35 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  32.2 
 
 
294 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  32.2 
 
 
294 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  32.2 
 
 
294 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  32.2 
 
 
294 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  32.2 
 
 
294 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.43 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.73 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.01 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.73 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.73 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  29.12 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.34 
 
 
294 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.63 
 
 
294 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  28.95 
 
 
294 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  28.63 
 
 
294 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.59 
 
 
243 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.72 
 
 
306 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  28.68 
 
 
311 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  30.26 
 
 
304 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.14 
 
 
323 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  31.29 
 
 
243 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  30.94 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.42 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  30.34 
 
 
270 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.5 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.05 
 
 
258 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.38 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.77 
 
 
273 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.85 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.03 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.39 
 
 
488 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  27.31 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.04 
 
 
283 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 
419 aa  89  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.36 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.85 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.42 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.54 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.44 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  27.99 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  28.36 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>