164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2731 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  99.6 
 
 
499 aa  1035    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  98.4 
 
 
499 aa  1023    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  100 
 
 
499 aa  1038    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  60.44 
 
 
507 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  86.57 
 
 
495 aa  922    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  60.45 
 
 
499 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  57.78 
 
 
500 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  56.32 
 
 
513 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  43.6 
 
 
467 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  59.52 
 
 
775 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  39.34 
 
 
485 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  59.14 
 
 
898 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  38.53 
 
 
466 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  39.29 
 
 
470 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  37.45 
 
 
471 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  37.45 
 
 
470 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  37.23 
 
 
471 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  36.81 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  36.38 
 
 
472 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  36.38 
 
 
472 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  36.38 
 
 
472 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  36.73 
 
 
473 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  36.17 
 
 
472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  36.17 
 
 
472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  36.38 
 
 
475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  36.65 
 
 
470 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  36.65 
 
 
470 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  36.67 
 
 
459 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  39.02 
 
 
416 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  33.88 
 
 
419 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  34.24 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  33.54 
 
 
462 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  32.43 
 
 
462 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  33.33 
 
 
423 aa  238  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  31.28 
 
 
449 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  31.07 
 
 
449 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  37.22 
 
 
675 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  35.71 
 
 
672 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  35.44 
 
 
680 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  40.18 
 
 
692 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  36.47 
 
 
679 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  30.16 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  39.46 
 
 
269 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  30.58 
 
 
541 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  39.62 
 
 
269 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  30.44 
 
 
541 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  29.55 
 
 
532 aa  186  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  30.28 
 
 
556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  29.44 
 
 
510 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  29.44 
 
 
510 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  29.02 
 
 
510 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  29.44 
 
 
510 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  28.72 
 
 
516 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  29.73 
 
 
510 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  30.69 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  30.08 
 
 
521 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  28.6 
 
 
510 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  29.02 
 
 
510 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  29.02 
 
 
510 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  29.09 
 
 
510 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  28.74 
 
 
538 aa  178  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  28.66 
 
 
511 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  28.75 
 
 
511 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  28.75 
 
 
511 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  28.18 
 
 
510 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  29.6 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  27.9 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  28.05 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  27.97 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  28.54 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  28.36 
 
 
517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  28.66 
 
 
511 aa  174  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  29.36 
 
 
515 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  27.88 
 
 
516 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  27.88 
 
 
519 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  28.18 
 
 
520 aa  173  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  27.79 
 
 
508 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  28.72 
 
 
523 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  27.85 
 
 
508 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  27.48 
 
 
517 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  27.68 
 
 
508 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  27.82 
 
 
519 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  27.77 
 
 
508 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  28.31 
 
 
520 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  28.92 
 
 
519 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4310  hypothetical protein  27.15 
 
 
549 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  27.57 
 
 
508 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  27.44 
 
 
508 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  28.31 
 
 
520 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  28.14 
 
 
515 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  27.48 
 
 
519 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  26.45 
 
 
505 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  27.76 
 
 
521 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  27.27 
 
 
513 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  27.25 
 
 
507 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>