32 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tter_1895  CDS  NC_013526  14443  17277  2835  CRISPR-associated helicase Cas3  YP_003323623  unclonable  2.46489e-08  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_1919  CDS  NC_013526  39299  40057  759  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003323647  unclonable  3.54716e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_1920  CDS  NC_013526  40013  41704  1692  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  YP_003323648  unclonable  1.99537e-10  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2030  CDS  NC_013526  155162  156628  1467  peptidase S26B, signal peptidase  YP_003323756  unclonable  6.43022e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2031  CDS  NC_013526  156644  157039  396  hypothetical protein  YP_003323757  unclonable  7.57072e-13  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2032  CDS  NC_013526  157282  157572  291  hypothetical protein  YP_003323758  unclonable  3.53816e-13  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2064  CDS  NC_013526  194790  196097  1308  hypothetical protein  YP_003323789  unclonable  7.0482e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2065  CDS  NC_013526  196609  197664  1056  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_003323790  unclonable  3.7262e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2101  CDS  NC_013526  231296  233212  1917  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  YP_003323825  unclonable  4.44895e-10  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2145  CDS  NC_013526  288491  291304  2814  protein of unknown function DUF1156  YP_003323868  unclonable  1.64543e-08  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2258  CDS  NC_013526  406126  406266  141  hypothetical protein  YP_003323979  unclonable  9.25005e-13  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2259  CDS  NC_013526  406268  406516  249  hypothetical protein  YP_003323980  unclonable  1.35355e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2260  CDS  NC_013526  406861  407853  993  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  YP_003323981  unclonable  3.13707e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2326  CDS  NC_013526  480066  481070  1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  YP_003324047  unclonable  1.19117e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2396  CDS  NC_013526  542144  542971  828  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  YP_003324114  unclonable  8.18527e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2397  CDS  NC_013526  543063  543407  345  protein of unknown function DUF488  YP_003324115  unclonable  1.31309e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2398  CDS  NC_013526  543413  544315  903  ABC transporter related protein  YP_003324116  unclonable  1.33291e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2399  CDS  NC_013526  544312  545037  726  ABC-2 type transporter  YP_003324117  unclonable  9.92199e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2400  CDS  NC_013526  545084  545275  192  hypothetical protein  YP_003324118  unclonable  1.82897e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2401  CDS  NC_013526  545505  545672  168  hypothetical protein  YP_003324119  unclonable  1.43773e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2402  CDS  NC_013526  545744  546907  1164  glycoside hydrolase family 76  YP_003324120  unclonable  6.69737e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2475  CDS  NC_013526  631557  632579  1023  transcriptional regulator, LacI family  YP_003324190  unclonable  2.32076e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2609  CDS  NC_013526  784483  785394  912  ABC transporter related protein  YP_003324319  unclonable  4.16385e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2610  CDS  NC_013526  785475  786908  1434  sulfatase  YP_003324320  unclonable  2.18719e-10  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2611  CDS  NC_013526  787037  787519  483  transcriptional regulator, MarR family  YP_003324321  unclonable  2.7069e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2612  CDS  NC_013526  787537  789234  1698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_003324322  unclonable  3.31464e-10  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2664  CDS  NC_013526  850141  853068  2928  hypothetical protein  YP_003324374  unclonable  4.90986e-08  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2704  CDS  NC_013526  895962  897155  1194  RNA methyltransferase, TrmA family  YP_003324414  unclonable  3.80281e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2705  CDS  NC_013526  897204  897764  561  protein of unknown function DUF955  YP_003324415  unclonable  2.14852e-12  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2706  CDS  NC_013526  897769  898038  270  hypothetical protein  YP_003324416  unclonable  6.44914e-13  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2707  CDS  NC_013526  898258  899529  1272  hypothetical protein  YP_003324417  unclonable  3.9594e-11  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2708  CDS  NC_013526  899539  902334  2796  alpha-L-rhamnosidase  YP_003324418  unclonable  1.30197e-08  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>