45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0875 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  938    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  69.33 
 
 
979 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  68.13 
 
 
1045 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  61.29 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  25.9 
 
 
1128 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  25 
 
 
1137 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  28 
 
 
1122 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.54 
 
 
1125 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  28.85 
 
 
1121 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  28.24 
 
 
1121 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  25.28 
 
 
1124 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  25.85 
 
 
1144 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  28.24 
 
 
1125 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.18 
 
 
1121 aa  96.7  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  28.35 
 
 
1133 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  27.16 
 
 
1121 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  27.81 
 
 
1140 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  25.64 
 
 
1143 aa  95.1  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  26.15 
 
 
1136 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.84 
 
 
1118 aa  92.8  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  28.05 
 
 
1121 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  25.34 
 
 
1126 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  27.74 
 
 
1153 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  26.72 
 
 
1143 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.48 
 
 
1154 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.38 
 
 
1124 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.16 
 
 
1118 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.16 
 
 
1120 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.16 
 
 
1120 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.85 
 
 
1130 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.51 
 
 
1120 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.51 
 
 
1126 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  24.83 
 
 
1123 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  25.42 
 
 
1166 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  22.9 
 
 
1121 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  25.08 
 
 
1120 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.31 
 
 
1146 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.68 
 
 
1125 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  24.37 
 
 
1133 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.46 
 
 
1151 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  26.03 
 
 
1181 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  30.23 
 
 
1120 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  22.36 
 
 
1114 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25.28 
 
 
1093 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  34.09 
 
 
352 aa  47.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>