More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2102 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  79.63 
 
 
713 aa  1147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  69.7 
 
 
700 aa  991  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  70.84 
 
 
700 aa  995  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  99.72 
 
 
705 aa  1453  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  67.89 
 
 
703 aa  945  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  70.27 
 
 
700 aa  1021  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  65.62 
 
 
698 aa  936  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  64.57 
 
 
714 aa  955  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  64.83 
 
 
703 aa  933  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1013  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1013  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  69.93 
 
 
702 aa  1013  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  59.15 
 
 
689 aa  844  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  57.28 
 
 
692 aa  810  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  64.41 
 
 
706 aa  929  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  64.71 
 
 
714 aa  960  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  60.99 
 
 
689 aa  867  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  69.99 
 
 
700 aa  1017  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  67.47 
 
 
703 aa  940  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  100 
 
 
705 aa  1457  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  58.91 
 
 
704 aa  859  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  58.96 
 
 
704 aa  849  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  58.38 
 
 
690 aa  834  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  59.44 
 
 
704 aa  847  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  62.5 
 
 
692 aa  924  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  59.55 
 
 
704 aa  859  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  57.69 
 
 
693 aa  837  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.75 
 
 
691 aa  835  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  89.84 
 
 
690 aa  1289  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  69.58 
 
 
723 aa  1021  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  70.41 
 
 
700 aa  1021  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  68.32 
 
 
701 aa  969  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  68.32 
 
 
700 aa  957  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1013  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  70.41 
 
 
700 aa  1027  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  68.09 
 
 
701 aa  960  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  60.48 
 
 
692 aa  852  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  69.93 
 
 
702 aa  1013  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  67.66 
 
 
699 aa  1006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  61.54 
 
 
692 aa  903  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  62.22 
 
 
691 aa  906  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  69.93 
 
 
702 aa  1013  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  61.79 
 
 
691 aa  903  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  62.5 
 
 
697 aa  905  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  61.19 
 
 
692 aa  860  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1953  elongation factor G  58.84 
 
 
694 aa  816  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0878239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  64.77 
 
 
698 aa  969  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  56.39 
 
 
700 aa  820  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  65.49 
 
 
730 aa  941  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  66.57 
 
 
706 aa  954  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  65.96 
 
 
697 aa  976  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  6.2878e-06  unclonable  9.8696e-12 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0983  elongation factor G  59.49 
 
 
699 aa  819  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.0684375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  56.59 
 
 
691 aa  815  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.19808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  65.63 
 
 
709 aa  966  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.11702e-07  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  64.83 
 
 
703 aa  938  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  56.1 
 
 
691 aa  813  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  60 
 
 
691 aa  843  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  67.66 
 
 
699 aa  1005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  68.23 
 
 
701 aa  954  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  70.41 
 
 
700 aa  1020  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  69.42 
 
 
700 aa  990  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  69.5 
 
 
702 aa  993  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  57.71 
 
 
705 aa  849  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  64.77 
 
 
698 aa  969  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  58.87 
 
 
691 aa  825  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  56.23 
 
 
698 aa  817  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  57.33 
 
 
698 aa  815  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  65.77 
 
 
698 aa  958  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  68.65 
 
 
704 aa  1003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  66.76 
 
 
701 aa  964  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  65.77 
 
 
698 aa  939  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1013  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  70.07 
 
 
704 aa  1013  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  67.76 
 
 
699 aa  961  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0484  elongation factor G  65.03 
 
 
715 aa  940  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00540157  normal  0.0564754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  57.02 
 
 
692 aa  835  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  59.23 
 
 
705 aa  818  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  58.45 
 
 
698 aa  811  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  56.33 
 
 
699 aa  817  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  59.86 
 
 
689 aa  862  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.89 
 
 
700 aa  821  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.70843e-05  decreased coverage  8.39395e-11 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  58.62 
 
 
691 aa  847  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  57.1 
 
 
705 aa  827  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  57.95 
 
 
695 aa  846  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  60.43 
 
 
692 aa  896  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3828  elongation factor G  69.65 
 
 
704 aa  1001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000816604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0318  elongation factor G  69.65 
 
 
704 aa  1003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000130884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  70.07 
 
 
704 aa  1013  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.69539e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  69.65 
 
 
704 aa  1009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  68.32 
 
 
700 aa  957  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  70.92 
 
 
708 aa  1026  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  9.14286e-06 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1427  elongation factor G  58.92 
 
 
699 aa  810  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00527133  normal  0.0124336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  61.33 
 
 
691 aa  877  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  59.72 
 
 
691 aa  855  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  59.29 
 
 
689 aa  872  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  56.39 
 
 
700 aa  811  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  58.12 
 
 
693 aa  833  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.03063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  57.82 
 
 
697 aa  811  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  67.09 
 
 
698 aa  968  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  56.31 
 
 
705 aa  817  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>