28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0016 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  707  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  30.71 
 
 
395 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  36.46 
 
 
374 aa  166  6e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  31.22 
 
 
394 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  34.62 
 
 
365 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  29.35 
 
 
396 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  33.79 
 
 
367 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  36.24 
 
 
368 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  34.47 
 
 
366 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  28.64 
 
 
397 aa  142  1e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  33.91 
 
 
368 aa  140  4e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  29.04 
 
 
397 aa  139  9e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  28.57 
 
 
397 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  25.98 
 
 
414 aa  115  1e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  26.5 
 
 
337 aa  76.3  8e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  29.08 
 
 
350 aa  73.9  3e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  22.77 
 
 
336 aa  73.6  5e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  24.74 
 
 
343 aa  72.4  1e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  26.57 
 
 
338 aa  67  5e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  26.41 
 
 
339 aa  66.2  8e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.88 
 
 
338 aa  65.1  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  23.59 
 
 
336 aa  60.5  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  23.7 
 
 
339 aa  55.5  2e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  53.9  4e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  23.7 
 
 
339 aa  53.9  5e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  21.78 
 
 
366 aa  53.1  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  23.51 
 
 
332 aa  50.1  6e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  23.49 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>