28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0016 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  30.71 
 
 		 395 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  36.46 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  31.22 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  34.62 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  29.35 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  33.79 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  36.24 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  34.47 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  28.64 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  33.91 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  29.04 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  25.98 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  26.5 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  29.08 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  22.77 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  24.74 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  26.57 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  26.41 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.88 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  23.59 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  23.7 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  28.66 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  23.7 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  21.78 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  23.51 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  23.49 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>