42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2056 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  92.73 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  98.04 
 
 
97 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  98.04 
 
 
79 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  96.08 
 
 
132 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  80.65 
 
 
109 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  94.23 
 
 
98 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  85.25 
 
 
102 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  89.29 
 
 
135 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  84.21 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  88.68 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  93.75 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  87.18 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  84.62 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  41.98 
 
 
522 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60 
 
 
563 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  70.45 
 
 
304 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75 
 
 
277 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  70.45 
 
 
2200 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  76.92 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  76.92 
 
 
3275 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  68.18 
 
 
394 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  76.92 
 
 
336 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  76.92 
 
 
514 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  76.92 
 
 
121 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  73.17 
 
 
514 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  74.36 
 
 
385 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  68.18 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  76.92 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  92.86 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  79.41 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  74.36 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  73.68 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  73.68 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  74.36 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  73.68 
 
 
305 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  73.68 
 
 
112 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  72.5 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  85.19 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  77.42 
 
 
79 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.6 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  40.8  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>