More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3090 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2091  cysteinyl-tRNA synthetase  84.53 
 
 		 458 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  81.05 
 
 		 461 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 462 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4936  cysteinyl-tRNA synthetase  76.09 
 
 		 460 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  84.53 
 
 		 458 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  78.24 
 
 		 470 aa  759    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  79.96 
 
 		 462 aa  774    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 463 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2320  cysteinyl-tRNA synthetase  78.65 
 
 		 459 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0745379  hitchhiker  0.000096837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3090  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 459 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 		 474 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  72.65 
 
 		 457 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  75.65 
 
 		 463 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  68.19 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  68.19 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  67.54 
 
 		 465 aa  628  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  67.97 
 
 		 465 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  67.1 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 465 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2113  cysteinyl-tRNA synthetase  67.1 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1203  cysteinyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 		 465 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0892832  normal  0.183053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 491 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 456 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1626  cysteinyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  68.49 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 455 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 454 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 465 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 460 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 460 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  52.89 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 460 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 460 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 459 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 459 aa  498  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>