49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0034 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  31.91 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  31.03 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  31.03 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  30.95 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  28.89 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  28.89 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  26.58 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  27.27 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0954  phosphopantetheine-binding  33.93 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.311548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  36.49 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  31.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  29.31 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  35.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  36.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  35.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  31.15 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  26.19 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  30.51 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  37.7 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  30.86 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 76 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  29.09 
 
 		 95 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 81 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>