183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001945 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  100 
 
 		 175 aa  360  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  97.14 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  88.51 
 
 		 181 aa  330  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  83.43 
 
 		 175 aa  311  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  78.16 
 
 		 175 aa  290  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  78.82 
 
 		 174 aa  287  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  78.82 
 
 		 175 aa  286  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  76.57 
 
 		 175 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  74.29 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  75 
 
 		 178 aa  276  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  75.29 
 
 		 175 aa  276  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  75.44 
 
 		 178 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  75.44 
 
 		 178 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  75.44 
 
 		 178 aa  276  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  74.42 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  74.42 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  74.42 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  74.42 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  73.26 
 
 		 178 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  69.64 
 
 		 169 aa  257  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  69.64 
 
 		 169 aa  257  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  69.64 
 
 		 169 aa  257  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  68.45 
 
 		 172 aa  255  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  66.67 
 
 		 169 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  69.14 
 
 		 166 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  65.48 
 
 		 168 aa  240  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  65.48 
 
 		 168 aa  240  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  62.73 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  63.58 
 
 		 165 aa  224  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  62.11 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  62.11 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  217  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  60.25 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  57.99 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 		 167 aa  183  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 		 167 aa  183  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  55.13 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  50 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  46.3 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  42.6 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.38 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  44.38 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  43.03 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  36.9 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  39.43 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  38.27 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  36.57 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  41.51 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  44.38 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  41.51 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  40.25 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  39.38 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  38.99 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  40.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  39.38 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  39.38 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  39.16 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  38.99 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  41.88 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  38.36 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  37.36 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  38.99 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  37.74 
 
 		 172 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  39.24 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  37.42 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  38.12 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  35.43 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  38.75 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  36.25 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  39.62 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  36.88 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  36.2 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  37.27 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  37.42 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  38.12 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  35.22 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  37.33 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  37.66 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  35.93 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>