201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1994 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.78 
 
 		 262 aa  324  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  66.22 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  47.51 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.61 
 
 		 245 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.53 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.18 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.67 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.53 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.18 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.18 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.18 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.18 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.56 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.88 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  41.92 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.92 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  41.92 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.7 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  41.92 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.92 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.92 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.92 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.92 
 
 		 236 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.38 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.64 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.24 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.24 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.24 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.39 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.86 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.77 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.94 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.94 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.94 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.08 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.44 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.05 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.29 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.13 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.29 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.91 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  39.41 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.14 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  40 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  36.48 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  41.79 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.36 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  40.69 
 
 		 238 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.49 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.6 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.11 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  39.02 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  39.69 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  38.64 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  35.22 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  34.5 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  36.1 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  37.76 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.28 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.12 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  33.61 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.39 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.64 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  38.5 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  37 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.69 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  37.31 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.04 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.7 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  35.97 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.69 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  27.8 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.99 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  26.57 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  32.67 
 
 		 178 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  30.7 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.69 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.9 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  27.69 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.63 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.7 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  29.96 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  25.93 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  25.93 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.05 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  25.51 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  25.51 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  25.51 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  25.51 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  25.94 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  25.1 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.53 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>