39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0184 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  100 
 
 
179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  41.24 
 
 
180 aa  123  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  39.89 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  38.82 
 
 
185 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  39.41 
 
 
185 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  39.41 
 
 
185 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  39.41 
 
 
185 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  39.66 
 
 
175 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  38.82 
 
 
185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  32.62 
 
 
186 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  40 
 
 
188 aa  99  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  34.83 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  33.16 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  33.51 
 
 
186 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  33.74 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  34.27 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  35.75 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  35.75 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  31.61 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  36.31 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  25.93 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  27.84 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  30.53 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  32.02 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  29.35 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  38.36 
 
 
128 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  39.39 
 
 
114 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  39.39 
 
 
114 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  31.19 
 
 
426 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  31.76 
 
 
129 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  31.76 
 
 
128 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>