23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0836 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  269  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  266  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  80.47 
 
 
128 aa  223  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  47.52 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  47.52 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  45.54 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  45.54 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  45.54 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  45.54 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  45.54 
 
 
114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  45.54 
 
 
114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  45.54 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  44.55 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  44.55 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  44.64 
 
 
119 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2949  TOPRIM domain protein  42.59 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  46.23 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0350  TOPRIM domain protein  39.05 
 
 
158 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  31.25 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  33.73 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  28.74 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  30.38 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  31.76 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>