More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2030 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
550 aa  1108    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  56.4 
 
 
547 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  53.47 
 
 
567 aa  618  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  57.14 
 
 
548 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  57.83 
 
 
548 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  55.99 
 
 
552 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  54.6 
 
 
552 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  55.15 
 
 
549 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  57.59 
 
 
543 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  57.81 
 
 
541 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  51.28 
 
 
547 aa  591  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  54.48 
 
 
546 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  58.1 
 
 
543 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.4 
 
 
531 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  53.96 
 
 
559 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  54.71 
 
 
548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  51.91 
 
 
549 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  52.84 
 
 
549 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  57.36 
 
 
560 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
550 aa  581  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  51.75 
 
 
549 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  53.65 
 
 
550 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  51.57 
 
 
548 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  52.66 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  52.76 
 
 
548 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 
549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 
549 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  57.01 
 
 
547 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  56.02 
 
 
541 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  52.83 
 
 
549 aa  568  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  55.01 
 
 
545 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  52.42 
 
 
562 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  51.64 
 
 
549 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  53.56 
 
 
547 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  54.53 
 
 
552 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  51.65 
 
 
554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  56.93 
 
 
546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  57.25 
 
 
550 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  53.38 
 
 
550 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  54.84 
 
 
561 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  54.61 
 
 
548 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  56.93 
 
 
546 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  49.19 
 
 
554 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 
551 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
554 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  53.51 
 
 
649 aa  556  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 
543 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  53.04 
 
 
550 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
550 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
550 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  54.1 
 
 
539 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  54.1 
 
 
539 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  51.28 
 
 
554 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  51.28 
 
 
554 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  53.56 
 
 
539 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  54.3 
 
 
539 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  51.28 
 
 
554 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  47.42 
 
 
547 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 
539 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  49.36 
 
 
548 aa  551  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
542 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  52.99 
 
 
550 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  54.4 
 
 
545 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
539 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  53.18 
 
 
548 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 
554 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 
554 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  54.19 
 
 
546 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 
554 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
554 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  48.9 
 
 
545 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 
547 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 
554 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  55.49 
 
 
556 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  58.44 
 
 
570 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 
545 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 
545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>