More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0429 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  71.74 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  61.36 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0658  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0682  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.651291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0431  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00947903  hitchhiker  0.00103246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  57.14 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  57.14 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  57.47 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  53.33 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  57.78 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  53.26 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  50.55 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.09 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  53.49 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  41.76 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>