19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1985 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  67.54 
 
 		 115 aa  160  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  64.6 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  63.72 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  61.06 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  60.34 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  55.65 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  53.1 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  41.51 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  47.37 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  38.66 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  48.72 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  28 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  30.95 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  38.96 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  29.06 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  29.82 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  25.42 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>