233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2373 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
438 aa  888    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.38 
 
 
433 aa  607  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  69.37 
 
 
428 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  72.66 
 
 
450 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.25 
 
 
424 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
433 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.53 
 
 
443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.66 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.2 
 
 
442 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.68 
 
 
439 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
437 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.05 
 
 
442 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  63.62 
 
 
446 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
465 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
440 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.81 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.92 
 
 
465 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.4 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.83 
 
 
430 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.05 
 
 
428 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.31 
 
 
432 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.25 
 
 
433 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 
473 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.62 
 
 
445 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.88 
 
 
438 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
440 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
440 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
440 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
454 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.85 
 
 
454 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.99 
 
 
462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 
461 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
455 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.68 
 
 
443 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
453 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
453 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
462 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
461 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
459 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
458 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 
446 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
451 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
453 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
451 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
458 aa  240  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
451 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
460 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
445 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 
460 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  36.26 
 
 
458 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
456 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
447 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
463 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
468 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
485 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
486 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.11 
 
 
465 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
457 aa  226  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
487 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
487 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
487 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
487 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 
468 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
487 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
487 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
449 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
489 aa  223  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 
487 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 
487 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.91 
 
 
487 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 
487 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
489 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 
467 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 
467 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
480 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.99 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.99 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
495 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
490 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
491 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
490 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>