More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4617 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
327 aa  667  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  58.16 
 
 
346 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  57.77 
 
 
349 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  57.86 
 
 
346 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  58.05 
 
 
341 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  55.88 
 
 
353 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  52.26 
 
 
373 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  50.85 
 
 
378 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  50.56 
 
 
378 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  50.56 
 
 
384 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  49.17 
 
 
380 aa  349  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 
362 aa  342  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  45.1 
 
 
366 aa  303  4e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  46.22 
 
 
344 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  43.54 
 
 
349 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  45.73 
 
 
342 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  41.16 
 
 
372 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  42.34 
 
 
362 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  41.05 
 
 
379 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  42.02 
 
 
362 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  43.84 
 
 
357 aa  286  3e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  42.15 
 
 
338 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  59.42 
 
 
379 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  54.55 
 
 
382 aa  242  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  38.56 
 
 
336 aa  221  2e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  35.86 
 
 
364 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  47.14 
 
 
383 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  36.02 
 
 
362 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.81 
 
 
323 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 
323 aa  201  1e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 
323 aa  201  1e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 
349 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  36.96 
 
 
323 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 
369 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.45 
 
 
323 aa  189  6e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 
329 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  32.83 
 
 
339 aa  184  2e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 
324 aa  183  4e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.74 
 
 
343 aa  183  4e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 
332 aa  183  4e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 
328 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 
328 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  30.53 
 
 
406 aa  180  3e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  31.38 
 
 
399 aa  179  5e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 
323 aa  179  6e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.4 
 
 
350 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.48 
 
 
417 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.55 
 
 
401 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.21 
 
 
324 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.52 
 
 
335 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.44 
 
 
408 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.08 
 
 
320 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.06 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.75 
 
 
320 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.37 
 
 
360 aa  175  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 
364 aa  174  1e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.31 
 
 
337 aa  174  2e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.49 
 
 
350 aa  173  3e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  30.12 
 
 
349 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  30.2 
 
 
353 aa  172  7e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  33.94 
 
 
319 aa  172  7e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  30.48 
 
 
361 aa  172  7e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.94 
 
 
316 aa  172  8e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 
320 aa  172  8e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.69 
 
 
326 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  41.75 
 
 
457 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.18 
 
 
347 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  34.8 
 
 
399 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 
360 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  32.81 
 
 
322 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  31.7 
 
 
352 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.78 
 
 
399 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.94 
 
 
316 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  30.69 
 
 
395 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  30.69 
 
 
395 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.85 
 
 
394 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  31.61 
 
 
347 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.84 
 
 
316 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.03 
 
 
374 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 
406 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.8 
 
 
369 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  32.57 
 
 
313 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  28.99 
 
 
408 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  30.64 
 
 
353 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  30.69 
 
 
395 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.84 
 
 
316 aa  166  3e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.75 
 
 
355 aa  167  3e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 
401 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  30.42 
 
 
527 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  30.42 
 
 
395 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.84 
 
 
319 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  30.95 
 
 
395 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  29.89 
 
 
367 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  30 
 
 
401 aa  166  6e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  30.37 
 
 
402 aa  166  6e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 
316 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.54 
 
 
316 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  30.69 
 
 
395 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  32.83 
 
 
404 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  29.47 
 
 
405 aa  165  1e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>